Blythe sairastuu eikä enää ymmärrä eläinten puhetta. Samaan aikaan Vinnie päätyy vahingossa kaatopaikalle. My Littlest Pet Shop kertoo pienestä mutta ystävällisestä lemmikkieläinkaupasta, jonka veikeät lemmikit osaavat puhua - mutta vain kaupan yläkertaan muuttaneelle Blythelle.