Dokumenttielokuvassa Transsukupuoliset lapset seurataan läheltä, mitä lapset kokevat ja käyvät läpi silloin, kun fyysinen sukupuoli on eri kuin koettu sukupuoli. Lapset kertovat itse avoimesti miltä tuntuu kun sukupuoli-identiteetti ei vastaa syntymässä määriteltyä sukupuolta. Dokumentti nostaa esiin myös lasten vanhempien ajatuksia aiheesta.
